一直以來，本站的留言區都有許多網友提交bug，或是遇到疑似bug的問題來發問，非常感謝各位！那這篇文章就是來統整本站蒐集到的究極綠寶石bug。
也歡迎之後有發現bug的朋友在這篇文底下留言，並且記得附註你玩的版本，因為有些3.0版的bug在最新元旦特別版（0.5體驗版）已經修復了！
還有希望大家知道一個概念，那就是「因為開金手指而導致的bug，都不算是bug！」為什麼這麼說呢？首先大家都知道遊戲bug指的就是「遊戲漏洞」，遊戲會產生漏洞就是因為程式寫得不夠好，導致運行時出了差錯。
而開金手指就是要違反遊戲本身已經寫好的程式，比如說寶可夢的遊戲程式就是設計成不能穿牆，如果有些牆可以穿那就是bug，也就是說開了穿牆金手指後，整個地圖就都充滿了bug，因此金手指也可以說是「讓遊戲產生bug來達到作弊的目的」。
所以說
「開了抓寵金手指後，遇到的寶可夢會名稱錯誤」
「用抓寵金手指抓到的Mega型態寶可夢戰鬥後會恢復原狀」
「開了閃光金手指後，遇到的寶可夢會幾乎都是同一種性別」
「開了滿個體金手指後，原本隊首寶可夢是隱藏特性結果變成特性1或特性2」
這些都不是bug喔！改版製作組也不太可能會修，因為這都是金手指的問題，不是遊戲本身的問題。
如果各位遇到bug時，注意一下是不是有金手指忘了關，說不定是金手指引起的，試著回到bug發生之前的存檔，把有開著的金手指通通關閉，存檔並重新讀取遊戲，說不定bug就解除了呢！
確定身上金手指都關閉後，bug依然存在，那就是遊戲真正的bug了，歡迎來留言提交喔！
嗯……說了這麼多，以下正文XDD
註：以下這些大部分都是《綠寶石802 3.0》的bug，我先整理出來，在最新的《究極綠寶石 0.5.1》中是否已經修復，我還尚未測試完畢，如已確認過我會再加以註明。
【0.5.1已修復】
※打完第六道館後，使敵方陷入異常狀態的招式都會失效，例如奇異之光、黑暗洞、蘑菇孢子。
※在雙打對戰中的第二隻精靈（右邊的）若有攜帶超進化石，不用Mega手環也能超進化。
※基格爾德26級學會「千箭齊發」而不是「大地神力」。
※一些傳授招式，實際教的招式與文本顯示的招式不一樣。
※選男主進行遊戲的話，角色頭上的驚嘆號會變成暗灰色，選女主則沒有此問題。
※覺醒祠堂「時空間」與赤日對話死機。（新版已取消此地圖）
【0.5.1尚未修復】
※與草Z結晶霸主對戰過後背包鎖死。
※向霸主丟球或被霸主打敗後，抓寶可夢球都會被擋掉，必須再次去挑戰任一霸主，逃跑或打贏，才會恢復。
※甜舞妮進化成甜冷美后等級降回26等，並且繼續升等後，在30等時才學會熱帶踢。
※河馬獸和甜冷美后的狀況類似，沙河馬34等進化成河馬獸之後退回29等。
※酋雷姆合體後冰封世界會改變，但鬼面不會改變。
※拉帝亞斯或拉帝歐斯無限遇。
※除了重量球以外的球都對阿爾宙斯貌似無效。
※阿爾宙斯攜帶妖怪石板後變為惡系，非幽靈系。
※蓋諾賽克特攜帶卡帶之後顏色變更錯誤。
※覺醒祠堂很多假的未知圖騰，抓不到，而且地震可以打中。
※雙打對戰時，同時出場的兩隻可以同時使用Z招式。
※雙打對戰時，對於同時出場的兩隻：第一隻使用Mega進化後第二隻可以接著使用Z招式；但若第一隻使用Z招式後第二隻無法接著使用Mega進化。
※利歐路進化時沒學會波導彈。
※伊布進化時，沒有學到該進化型態應學到的招式。
※永恆之花50級無法學會「破滅之光」
※阿羅拉型態的椰蛋樹無法教會流星群。
※紅花以外的花潔夫人無法正常使用技能機。
※母的火炎獅無法正常使用技能機。
※母的轟隆雉雞（高傲雉雞）無法正常使用技能機。
※西海型態的海兔獸無法正常使用技能機。
※垃圾蓑衣與砂土蓑衣型態的結草貴婦無法正常使用技能機。
※垃圾蓑衣與砂土蓑衣型態的結草貴婦透過升級學會的招式相反了。
※銅鏡怪35等才進化，與官方設定不同。
※頑皮熊貓官方設定是與惡系同行並32等進化，然而究極綠寶石是與一般系同行才能進化，且17等就會進化。
※特性為危險預知的伊布進化成葉精靈後，特性變成壓迫感，應該是葉綠素才對。
※若連線對戰，2P（客戶端）無法正常進行Mega進化與原始回歸。
※寶可夢改變型態後，名稱（暱稱）不會跟著型態改變。
※巴爾郎只要升級就會進化，與官方設定的20等不同。
※有爆炸烈焰和瘋狂植物的定點教學，但加農水炮（水電炮）貌似沒有加入。
【尚未確認0.5.1是否修復】
※胡帕的所在地，一周目去時遇不到（但可以拿到懲戒之壺），二周目才會出現。
※部分技能如寶石力量、電光一閃，使用後有機率觸發bug，動畫非常慢、戰鬥畫面的寶可夢位置偏移，技能動畫完過後變正常。
※對戰帳篷如果戰敗、中途離開或勝利都有機率背包清空。
※球球海獅性別比可能有問題。
【0.5.1多出來的bug】
※抓究極異獸的洞出不來，必須使用穿洞繩or挖洞or被神獸打死自動傳出來。
※卡璞・鳴鳴的原所在地沒有看到，其它地方也找不到。
※東海型態的海兔獸圖片沒弄好，小圖是藍色，大圖是紅色。